Als der spanische König Carlos III. 1767 die Ausweisung der Jesuiten aus Südamerika befahl, zerfielen die meisten Niederlassungen. So auch San Ignacio Mini, die grösste der Jesuitenniederlassungen. Die Siedlung zerfiel und der Urwald überwucherte das Gelände. Heute sind die Ruinen wieder zugänglich und ein Museum legt Zeugnis ab von der bewegten Geschichte der Jesuiten in Südamerika